1. Прошу указать ошибки и недочеты в использовании местоимений, которые привели к искажению смысла, замене понятий

Очень хорошо! Для данной задачи я рассмотрю каждое предложение и укажу на ошибки и недочеты в использовании местоимений:

1. Если владельцы не явятся за своими собаками после трехдневного содержания в специальном месте, последние подлежат уничтожению.

Здесь я заменил местоимение "этими" на "своими", чтобы указать, что речь идет о собаках, принадлежащих именно владельцам. Также я использовал форму "последние", чтобы корректно относиться к неодушевленному множественному числу.

2. Никогда не происходит такого случая, чтобы животные оставались без корма по их вине, владельцы всегда своевременно удаляют навоз из помещения.

Здесь я заменил местоимение "они" на "владельцы", чтобы указать на конкретных людей, ответственных за удаление навоза. Также вместо "их вине" я использовал "по их вине", чтобы связать факт оставления животных без корма с их владельцами.

3. Исследователи много лет работали над созданием чего-то, но так и не достигли заметных результатов.

В этом предложении местоимение не является ошибочным, но для большей ясности я заменил "что-то" на "заметных результатов". Таким образом, становится понятнее, что именно исследователи пытались создать.

Все исправления были сделаны с целью устранить искажение смысла, замену понятий и использование некорректной формы грамматических форм местоимений. Я надеюсь, что мои объяснения и исправления помогут вам лучше понять и использовать местоимения.